Diplômée d’un Master II recherche en Études Théâtrales à Paris III et de la section mise en scène du CNSAD en 2014, Margaux Eskenazi a travaillé trois ans au Théâtre du Rond- Point au comité de lecture. Elle a ensuite très vite développé une activité de collaboratrice artistique avec Eric Didry, Nicolas Bouchaud, Jean-Claude Grumberg, Vincent Goethals, Xavier Gallais, Cécile Backès, le Birgit Ensemble et Clément Poirée. Depuis 2019, elle conçoit également des dramaturgies de films documentaires pour France Ô.
Son activité de metteuse en scène débute en 2007 – année où elle fonde la Compagnie Nova. Elle a monté Quartett d’Heiner Müller, Hernani de Victor Hugo et Richard III de William Shakespeare.
Entre 2016 et 2023, elle a développé un triptyque « Écrire en pays dominé » consacré aux amnésies coloniales et aux poétiques de la décolonisation : Nous sommes de ceux qui disent non à l’ombre, Et le coeur fume encore, 1983, pour lequel elle fut invitée au TNP-Villeurbanne. Pour chaque spectacle de ce triptyque, des formes en itinérance en lien avec les formes en salle sont créées : Césaire-Variations, Kateb-Variations et Après Babel. Au printemps 2021, Margaux Eskenazi crée Gilles ou qu’est-ce qu’un samouraï, à partir de la conférence de Gilles Deleuze, Qu’est-ce que l’acte de création ?.
Elle intervient également dans les Écoles Supérieures d’Art Dramatique pour mener des ateliers auprès des élèves : l’École de la Comédie de Saint-Etienne, l’Esad à Paris, l’École du Nord à Lille.
En mars 2023, elle assure la dramaturgie et met en scène Estelle Meyer dans Niquer la fatalité.
En janvier 2024, elle crée Si Vénus avait su, spectacle en lieux non-dédiés, sur une commande du théâtre de la Poudrerie (Sevran). Elle crée également le spectacle de sortie de la Belle Troupe en juin 2024 au Théâtre de Nanterre-Amandiers, Kaddish-mémoires autour de la littérature d’Imre Kertész.
En 2025 elle crée Les jeunes filles du Bon Pasteur avec le NTP. En 2026, elle crée : Kaddish, la femme chauve en peignoir rouge et Foudroyantes, son premier spectacle jeune public. Elle est actuellement artiste associée au Théâtre Jean Vilar (Vitry).